Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21897J3KMP5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms