Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AK157302I3ITR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AK157302I3ITR1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms