Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubap1lG3UW59 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubap1lG3UW59 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms