Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm28038F7BCN9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28038F7BCN9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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