Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28048F7BCN0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28048F7BCN0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms