Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms