Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cald1E9QA15 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms