Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms