Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Urb2E9Q7L1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Urb2E9Q7L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms