Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BC030500E9Q6W0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC030500E9Q6W0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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