Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Simc1E9Q6E9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Simc1E9Q6E9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Simc1E9Q6E9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms