Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc85cE9Q6B2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms