Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BC005561E9Q5E2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BC005561E9Q5E2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms