Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
5031410I06RikE9Q4E0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
5031410I06RikE9Q4E0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms