Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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