Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3095E9Q058 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3095E9Q058 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms