Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chd2E9PZM4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd2E9PZM4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms