Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms