Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan18E9PUD6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan18E9PUD6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms