Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Soga1E1U8D0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Soga1E1U8D0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms