Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms