Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mterf1bB9EJ57 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms