Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5483B2RV77 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5483B2RV77 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms