Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc8B2RUS7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Abcc8B2RUS7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Abcc8B2RUS7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms