Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtprbB2RU80 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms