Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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