Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf518bB2RRE4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf518bB2RRE4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms