Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn7aB1AYL1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn7aB1AYL1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms