Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms