Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm436B1AVU6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms