Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700084M14RikB1AT01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms