Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox1B1APN4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox1B1APN4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms