Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms