Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms