Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtf1A2AQ19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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