Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700023F06RikA2AB62 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms