Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71e1A1L3C1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71e1A1L3C1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms