Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms