Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms