Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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