Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Usp29Q9ES63 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp29Q9ES63 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms