Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Zbed3Q9D0L1 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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Zbed3Q9D0L1 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms