Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NipblQ6KCD5 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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