Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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