Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ptchd1Q14B62 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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