Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VdrP48281 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
VdrP48281 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VdrP48281 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
VdrP48281 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VdrP48281 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms