Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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