Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VhlP40338 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VhlP40338 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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