Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usf3B2RUQ2 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms