Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Limd1Q9QXD8 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Limd1Q9QXD8 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Limd1Q9QXD8 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Limd1Q9QXD8 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Limd1Q9QXD8 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Limd1Q9QXD8 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Limd1Q9QXD8 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Limd1Q9QXD8 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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